Formations PMSI R
Produire des dataframe R à partir des fichiers du PMSI pour analyser, en toute autonomie, le PMSI de mes établissements avec R
Vendredi 6 décembre 2024 de 9h à 12h30
Objectifs
1| Apprendre à manipuler les fichiers normalisés de production du PMSI (rss, rsa, rhs, fichcomp, Visual Valo, …) au format texte ou csv en R pour produire des data frames de données exploitables en analyse PMSI.
2| Etre autonome dans la manipulation des fichiers PMSI en R
Programme
Rappel R et PMSI (30 minutes)
Les packages et fonctions du Tidyverse utiles pour manipuler les fichiers PMSI
Import d’un fichier FICIUM en dataframe/tibble
Manipulations élémentaires de variables PMSI
Import de fichiers PMSI à longueur fixe (30 minutes)
Démarche générique d’imports des fichiers PMSI
Script générique commenté d’import des fichiers PMSI à longueur fixe
Exemples : fichiers FICHCOMP DMI, partie fixe d’un fichier RSS, partie fixe d’un fichier RHS, fichier Visual Valo séjours
Nettoyage et enrichissement (1 heure)
Normalisation des variables
Nettoyage des variables post-import
Enrichissement : libellés et données OVALIDE
Pause (15 minutes)
Import des fichiers PMSI à longueur variable (45 minutes)
Script d’import complet d’un fichier RSS dans une list de tibbles (rum, das, dad, ccam)
Généralisation : RHS, RSA, RPS, …
Séance Questions/Réponses (30 minutes)
Pré-requis
Maîtrise du PMSI, des formats et des logiques des fichiers de production du PMSI
Manipulations de base en R avec le Tidyverse
Environnement de travail avec un IDE R : R Studio ou VS Code
Méthodologie
La formation se déroule selon les principes du live coding : explications
Les scripts sont exécutés avec des fichiers textes de quelques lignes, conçus par nos soins, au format ATIH 2024.
Le livrable de la formation est un fichier de code R avec l’ensemble des scripts et exercices de la formation.
Formateur
La formation est conçue et animée par denis Gustin, ingénieur, concepteur et développeur de PMSISoft, logiciel d’analyse PMSI développé principalement en R.
Il est spécialiste en données PMSI avec plus de 15 ans d’expérience dans les différents PMSI et intervient régulièrement, en tant que formateur et consultant, dans des établissements de santé sur des problématiques d’analyses PMSI et de données de santé.
Il développe et maintient le package R de données PMSI refpmsi::.
Il anime le blog lespmsi.com
Tarif de la formation
400€ / personne sous convention de formation
Pré-inscription
Pré-inscription en sélectionnant l’objet “Formation Fichiers PMSI en dataframe R”
A réception de votre demande de pré-inscription nous vous recontacterons pour :
1| valider avec vous votre inscription
2| communiquer la convention de formation
3| communiquer les conditions générales de vente (CGV)
4| communiquer le règlement intérieur de la formation