Episodes de soin continu par IPP

Introduction

Pour la définition des épisodes de soin continu en hospitalisation complète, voir ici

Dans un premier tibble, sur la base des RPS de temps complet, on repère et comptabilise par IPP, les épisodes de soin continu.

Dans un second tibble, on calcule par IPP le nombre de séjours temps complet et le nombre d’épisodes de soin continu.

Code

library(dplyr)

vect_fa_temps_complet <- c('01','01D','01S','01P','02','03','04','05','06','07')

rps_episode_soin_continu <- psy_rps$rps %>% 
    dplyr::select(forme_activite,no_ipp,no_sejour,date_debut_sequence,date_fin_sequence,nb_jours_presence) %>% 
    dplyr::filter(forme_activite %in% vect_fa_temps_complet) %>% 
    dplyr::group_by(no_ipp) %>% 
    dplyr::arrange(date_debut_sequence, .by_group = TRUE) %>% 
    dplyr::mutate(same_episode_soin_continu_ipp = as.integer(date_debut_sequence-dplyr::lag(date_fin_sequence, default = date_debut_sequence[1])) <= 1L,
                  cumsum_episode_soin_continu_ipp = cumsum(!same_episode_soin_continu_ipp)+1L,
                  nb_episode_soin_continu_ipp = max(cumsum_episode_soin_continu_ipp)) %>% 
    dplyr::ungroup()
rps_episode_soin_continu

ipp_episode_soin_continu <- rps_episode_soin_continu %>% 
    dplyr::distinct(no_ipp,no_sejour,nb_episode_soin_continu_ipp) %>% 
    dplyr::mutate(.by = no_ipp, nb_sejour_ipp = dplyr::n()) %>% 
    dplyr::distinct(no_ipp,nb_sejour_ipp,nb_episode_soin_continu_ipp)
ipp_episode_soin_continu

Commentaires

Ligne 3 : le vecteur vect_fa_temps_complet correspond aux codes des formes d’activité temps complet

Ligne 5 : psy_rps$rps est un tibble des variables de la partie fixe d’un fichier RPS. Voir Guide des scripts - Jeux de données

Ligne 9 : l’argument .by_group = TRUE dans le dplyr::arrange() permet de trier au sein d’un regroupement.

Lignes 10 à 12 : codage de l’algorithme de définition d’un épisode de soins continus

Pour aller + loin :
Repérage concomitant des épisodes de soin concentré (séquences séparées de 0 à 7 jours dans un même épisode)
Attribution d’une numérotation aux épisodes de soin continu
Etc …

Cette analyse est réalisée dans PMSISoft PSY dans l’écran Séjours > Base des séjours avec, en particulier, le calcul du nombre d’épisodes de soin continu et du nombre d’épisodes de soin concentré.

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